Die Därme sind die Heimat vieler Arten freundlicher Bakterien, die eine symbiotische Beziehung zum Körper haben und ihn vor Krankheiten schützen. Diese Probiotika hemmen schädliche Bakterien auf zahlreiche Weise. Ein Mangel tritt normalerweise aufgrund einer Antibiotikabehandlung bei einer Infektion auf, einer Behandlung, die nicht nur die schädlichen Bakterien, sondern auch die guten Bakterien tötet. Die meisten Symptome sind gastrointestinaler Natur.
Probiotika kommen in fermentierten Lebensmitteln wie Joghurt, einigen Käsesorten, Tempeh und Miso vor. Probiotika-Präparate sind ebenfalls für Menschen erhältlich, die einen Mangel haben könnten.
Verdauungsprobleme sind die Hauptsymptome eines Probiotika-Mangels. Häufige Verdauungsstörungen, Magenschmerzen, Durchfall, Verstopfung, Blähungen und Übelkeit können alle auf einen Probiotika-Mangel hinweisen.
Menschen mit einem Reizdarmsyndrom haben oft einen Probiotika-Mangel, und mehrere Studien haben die Wirksamkeit von Probiotika-Therapie bei der Behandlung des Reizdarmsyndroms gezeigt. Ärzte hielten mehrere relevante Vorträge auf der Digestive Disease Week-Konferenz im Jahr 2003 (siehe Ressourcen).
Menschen mit Probiotika-Mangel können auch eine Laktoseintoleranz oder Lebensmittelunverträglichkeiten entwickeln, die Hautausschläge verursachen.
Weitere Symptome eines Probiotika-Mangels sind Pilzinfektionen, Harnwegsinfektionen oder Pilzinfektionen wie Fußpilz, was auf einen Mangel an freundlichen Bakterien hinweist.

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