Der Dünndarm beherbergt eine eigene, niedrigbiomasse Mikrobiota (~10³–10⁴ CFU/ml) im Vergleich zum Dickdarm. Wichtige nützliche Gattungen und ihre Rollen:
Lactobacillus
- Produziert Milchsäure → senkt pH, hemmt Pathogene.
- Laktoseverdauung (β-Galactosidase); reduziert Symptome der Laktoseintoleranz.
- Verbessert Barrierefunktion; moduliert Mukosa-Immunität.
Streptococcus (z. B. S. thermophilus, S. salivarius)
- Proteinhydrolyse → bioaktive Peptide.
- Vitaminsynthese (Folsäure, B12).
- Frühe Besiedler; prägt Immunentwicklung.
Bifidobacterium
- Milch-/Essigsäureproduktion; kompetitiver Ausschluss von Pathogenen.
- Komplexe Kohlenhydratmetabolisierung (HMOs bei Säuglingen, Ballaststoffe).
- SCFA-Produktion (Acetat, Laktat) → Butyrat-Cross-Feeding.
Escherichia coli (Kommensale Stämme)
- Kohlenhydrat-, Protein-, Fettfermentation.
- Vitamin K₂ (Menaquinon) und Biotinsynthese.
- Kolonisierungsresistenz durch Mikrozine, kompetitiver Ausschluss.
- Hinweis: Nur nicht-pathogene Stämme; EHEC/EPEC sind Pathogene.
Enterococcus (z. B. E. faecium)
- Breite Substratnutzung (Kohlenhydrate, Proteine, Fette).
- Bakteriocinproduktion; hemmt Gram-Positive.
- Einige Stämme als Probiotika; andere opportunistische Pathogene (VRE).
Bacteroides
- Primäre Abbauern komplexer Polysaccharide (Cellulose, Xylan, Pektin).
- Haupt-SCFA-Produzenten (Acetat, Propionat, Succinat) → Energie für Kolonozyten, systemische Signalgebung.
- Gallsäure-Deconjugation/-Modifikation.
Clostridium (Cluster IV, XIVa – Kommensal)
- Butyrat-Produzenten (Faecalibacterium, Roseburia, Eubacterium) – kritisch für Kolonozytengesundheit, entzündungshemmend.
- Sekundäre Gallsäuremetabolisierung (7α-Dehydroxylierung).
- Sporebildend; resistent.
Fusobacterium
- Butyratproduktion; entzündungshemmend.
- Oral-Darm-Achse; einige Arten mit Kolorektalkarzinom assoziiert (F. nucleatum) – kontextabhängig.
Klinische Relevanz
- SIBO (Small Intestinal Bacterial Overgrowth) – Dysbiose, nicht nur „gut/schlecht“.
- Probiotika modulieren transient; Präbiotika (GOS, FOS, Inulin) ernähren Bewohner.
- Antibiotika verursachen Kollateralschäden; engspektrum bevorzugt.
Eine vielfältige, ausgewogene Dünndarmmikrobiota unterstützt Verdauung, Immunität und metabolische Gesundheit.