Lebensmittelsicherheit ist ein zunehmend wichtiges Thema, doch Kaffee ist eine ungewöhnliche Quelle für Lebensmittelvergiftungen. Während sich Fachleute eher mit Fleisch, Milchprodukten und gekochten Lebensmitteln befassen, kann Kaffee mit Ochratoxin und Schimmel kontaminiert sein. Auch Milch und Sahne können durch Lebensmittel übertragene Krankheiten übertragen.
Schimmelpilze verderben meist Lebensmittel, ohne Krankheiten zu verursachen, können aber in Luft, Boden, Pflanzen, Wasser und Nahrungsmitteln vorkommen. Einige produzieren Aflatoxin, das Lebererkrankungen verursachen kann. Kaffee ist ein potenzieller Wirt für Aflatoxin produzierende Schimmelpilze, da er in tropischen Klimazonen mit hoher Luftfeuchtigkeit wächst. Auch Ochratoxin, ein weiteres Pilzgift, kann in Kaffee vorkommen.
Bakterielle Kontamination ist die häufigste Ursache für durch Milchprodukte verursachte Lebensmittelkrankheiten. Bakterien können Gastroenteritis, Listeriose und Salmonellose verursachen. Milch sollte bei mindestens 41 Grad kalt gehalten werden; beim Erhitzen von Milch und Kaffee sollte das Getränk über 140 Grad erhitzt werden. Haltbarkeitsdaten sind einzuhalten.

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