Dies bedeutet, dass die Milch vor der Herstellung des Käses so behandelt wird, dass alle Bakterien abgetötet werden – manche gesund, manche nicht. Rohmilchkäse werden aus nicht pasteurisierter Milch hergestellt und sind nach Meinung einiger der leckerste Käse, den man finden kann. Die US-amerikanische Food and Drug Administration gibt jedoch an, dass nicht pasteurisierter Weichkäse und nicht pasteurisierte Milch für den Verzehr als unsicher gelten. Allerdings können Sie einige Rohmilchkäse legal kaufen, solange sie mindestens 60 Tage gereift sind.
Pasteurisierte Käse sind die in Märkten und Lebensmittelgeschäften am häufigsten verwendete Käseart, sowohl industriell als auch handwerklich hergestellt. Pasteurisierter Käse wird aus Milch hergestellt, die mindestens 30 Minuten lang auf 140 oder 150 Grad Fahrenheit erhitzt wurde, bevor die Temperatur gesenkt wird, jedoch nicht weniger als 55 Grad. Laut FDA gelten sowohl harte als auch weiche Sorten als sicher für den regelmäßigen Verzehr.
Rohmilchkäse aufgrund ihres nicht pasteurisierten Milchgehalts – entweder von Ziegen, Kühen oder Schafen – haben mehr Geschmack und Komplexität als ihre pasteurisierten Gegenstücke. Rohmilchkäse, der in den USA noch neu ist, ist Teil einer traditionellen Ernährung in weiten Teilen Europas und wird in kleinen Mengen von handwerklichen Käsemachern in den USA hergestellt. Eine große Anzahl von Rohmilchkäsen wird importiert.
Pasteurisierung tötet alle in der Milch enthaltenen Bakterien ab und ergibt einen erregerfreien Käse. Es sind noch nicht pathogene Organismen vorhanden, die dazu führen können, dass der Käse verdirbt, wenn er nicht ordnungsgemäß im Kühlschrank gelagert wird. Listerien, Salmonellen und E. coli sind potenzielle Krankheitserreger, die eher in Rohmilchkäse als in pasteurisiertem Käse vorkommen. Rohmilchkäse werden von kleinen Herstellern hergestellt, die ihre Produkte häufig strengen Tests unterziehen, um sicherzustellen, dass keine Kontamination durch schädliche Bakterien wie E. coli, Hefe oder coliforme Bakterien vorliegt. Laut einer 2009 erschienenen Ausgabe von „Foodborne Pathogens and Disease“ gibt es jedoch nur wenige wissenschaftliche Studien, die die Sicherheit von Rohmilch im Allgemeinen belegen. Das Kennenlernen der Sicherheitsmaßnahmen unabhängiger Erzeuger kann dazu beitragen, mögliche Infektionen durch kontaminierte Rohmilch zu verhindern.
Rohmilchkäse können zwar Bakterien in der Milch enthalten, doch die Befürworter von Rohmilchprodukten argumentieren, dass pasteurisierter Käse auch die Gefahr von Krankheitserregern birgt. Bei unsachgemäßer Handhabung und Lagerung von pasteurisierter Milch und Käse können schädliche Krankheitserreger sowie mögliche Kreuzkontaminationen auftreten. Für schwangere Frauen, Menschen mit geschwächtem Immunsystem und Kinder empfiehlt die FDA keinen Verzehr von Rohmilchkäse. Schwangere sind besonders gefährdet, wenn sie mit Listeria infiziert sind, einem Bakterium, das Fehlgeburten sowie Tod oder Krankheit bei Neugeborenen verursachen kann.

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