Der Magen hält einen pH-Wert von 1,5–2,0 durch eng koordinierte zelluläre Mechanismen aufrecht:
Sekretieren HCl über H⁺/K⁺-ATPase (Protonenpumpe). Carboanhydrase katalysiert CO₂ + H₂O → H⁺ + HCO₃⁻; H⁺ wird in den Lumen gepumpt, HCO₃⁻ gelangt ins Blut („alkaline tide“).
Geben Pepsinogen ab, das durch Magensäure zu Pepsin aktiviert wird für die Proteinverdauung.
Hormon, das als Reaktion auf Peptide, Dehnung und vagale Stimulation freigesetzt wird; stimuliert Parietal- und Chief-Zellen.
Oberflächenschleimzellen sezernieren hochmolekuläres Schleim; unterliegende Epithelzellen sezernieren HCO₃⁻, das im Gel eingeschlossen ist und einen pH-Gradienten schafft, der die Schleimhaut schützt.
Pankreas- und Brunner-Drüsen-Bikarbonat (stimuliert durch Sekretin) neutralisiert sauren Chymus, der in den Duodenum gelangt.
Säure ermöglicht Protein-Denaturierung, aktiviert Pepsin, befreit Vitamin B₁₂ aus Nahrung, ionisiert Mineralien (Eisen, Kalzium) für die Absorption und tötet eingenommene Krankheitserreger ab.

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