Die hyperbare Sauerstofftherapie ist vor allem für ihre Anwendung bei der Behandlung von Dekompressionskrankheit bei Tiefseetauchern bekannt. Sie hat auch große Vorteile für andere Erkrankungen, hauptsächlich im Bereich der Wundversorgung und zur Behandlung von Kohlenmonoxidvergiftungen. Einige Praktiker verschreiben hyperbare Medizin für eine breite Palette anderer Störungen, obwohl die Schulmedizin ihre Anwendung für solche Zustände im Allgemeinen nicht akzeptiert hat.
Die Dekompressionskrankheit, auch „Taubigkeit“ genannt, tritt auf, wenn Tiefseetaucher zu schnell auftauchen und Stickstoffblasen in ihrem Blut entwickeln. Hyperbare Medizin löst dieses Problem. Bei dieser Therapie atmet der Patient 100 Prozent Sauerstoff in einer hyperbaren Kammer, während der Druck um seinen Körper langsam erhöht wird, normalerweise bis zu dreimal so hoch wie der normale atmosphärische Druck. Die hyperbare Sauerstofftherapie für Dekompressionspatienten wird häufig von Krankenhäusern, Marineeinheiten und Tauchorganisationen verwendet.
Die Undersea and Hyperbaric Medical Society hat die hyperbare Sauerstofftherapie für Wundversorgungsfragen wie nekrotisierende Weichteilinfektionen, Gewebeschäden durch Strahlung, Gasbrand, Quetschverletzungen, Verbrennungen, hartnäckige Knocheninfektionen, Gehirnabszesse, Hauttransplantationen und chronisch nicht heilende Wunden genehmigt. Weitere von der UHMS genehmigte Anwendungen umfassen die Behandlung von Kohlenmonoxidvergiftung, Blausäurevergiftung und Anämie aufgrund plötzlichen Blutverlusts.
Ärzte in den Vereinigten Staaten dürfen gesetzlich die hyperbare Sauerstofftherapie für andere Erkrankungen verschreiben, selbst wenn sie nicht von der UHMS genehmigt sind. Diese Erkrankungen werden von der etablierten medizinischen Gemeinschaft allgemein als experimentell betrachtet und umfassen Bisse der Braunen Recluse-Spinne, Borreliose, Hansen-Krankheit (Lepra), Darmverschluss, schwere Kopfverletzung sowie Herzinfarkt oder Schlaganfall.
Weitere Möglichkeiten der hyperbaren Medizin werden von der etablierten medizinischen Gemeinschaft im besten Fall als fragwürdig betrachtet. Das Online-Journal Hyperbaric Medicine Today, dessen Verleger die Aufgabe haben, die etablierte Akzeptanz eines breiteren Spektrums von Behandlungen zu sichern, stellt fest, dass sie Forschung zur hyperbaren Medizin bei Autismus, Multipler Sklerose, Kopfschmerzen, Neuropathie und Sportverletzungen veröffentlichen.
Die Behandlung von Erkrankungen, die nicht von der UHMS genehmigt sind, ist eine Quelle fortwährender Kontroversen unter Ärzten und anderen medizinischen Fachkräften. Ein Artikel aus dem Jahr 2005 im Journal of American Physicians and Surgeons diskutiert den intensiven „Emotionalismus und politischen Manöver“ im Zusammenhang mit Behauptungen und Gegenbehauptungen zur hyperbaren Sauerstofftherapie bei Multipler Sklerose. Eine weitere Kontroverse betrifft die Anwendung der hyperbaren Medizin zur Behandlung des spätstadium erworbenen Immundefizienzsyndroms (AIDS).

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