Pepsin und Trypsin verdauen Proteine in unterschiedlichen Stadien, weil sie für unterschiedliche Umgebungen spezialisiert sind:
| Eigenschaft | Pepsin (Magen) | Trypsin (Dünndarm) |
|---|---|---|
| Optimaler pH-Wert | 1,5–2,0 (hochsauer) | 7,5–8,0 (leicht alkalisch) |
| Optimale Temperatur | ~37 °C (Körpertemperatur) | ~40–45 °C (etwas höher) |
| Substratspezifität | Spaltet Bindungen neben aromatischen Aminosäuren (Phe, Tyr, Trp) | Spaltet Bindungen neben basischen Aminosäuren (Lys, Arg) |
| Aktivierung | Wird als Pepsinogen sezerniert; aktiviert durch HCl | Wird als Trypsinogen sezerniert; aktiviert durch Enterokinase |
Diese sequentielle, kompartimentierte Wirkung gewährleistet eine effiziente Proteinverdauung ohne enzymatische Interferenz.

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