Embryonale Stammzellen besitzen die größte Fähigkeit zur Zelltransformation und entwickeln sich zu allen Zellen, die notwendig sind, um einen gesunden Organismus hervorzubringen. Adultstammzellen, die im Knochenmark und in somatischen (Körper-)Zellen vorkommen und chemisch und genetisch angeregt werden, um Stammzellen zu werden, haben ebenfalls das Potenzial für zelluläre Transformation. Die ethischen Fragen rund um die menschliche Zelltransformation beziehen sich primär auf die Definition menschlichen Lebens und das Recht von Wissenschaftlern, dieses Leben für das allgemeine Wohl zu zerlegen oder zu verändern.
Im September 1999 gab die Nationale Bioethik-Beratungskommission (NBAC) „Ethische Fragen in der menschlichen Stammzellforschung“ heraus, das die aktuelle Stammzellforschung und die ethischen Fragen bei der Verwendung embryonaler Stammzelllinien und somatischer oder adulter Stammzelllinien abdeckt. Das endgültige Urteil der NBAC führte dazu, dass die US-Regierung die Finanzierung embryonaler Stammzellforschung aussetzte. Stattdessen ermutigte die Bundesregierung die Verwendung bestehender Stammzelllinien und die Fortsetzung der Forschung mit adulten Stammzellen. Im Jahr 2009 wurde das Verbot der Bundesfinanzierung für embryonale Forschung aufgehoben, sofern Labore die Forschungsrichtlinien der National Institutes of Health erfüllen.
Der Großteil der embryonalen Stammzellforschung nutzt entsorgte, eingefrorene Embryonen, die ursprünglich für die künstliche Befruchtung (IVF) hergestellt wurden. Anfangs und in einigen privat finanzierten Forschungseinrichtungen fortgesetzt, erzeugen Forscher jedoch embryonale Stammzelllinien durch künstliche Befruchtung einer Spendereizelle ausschließlich zu Forschungszwecken. Um embryonale Stammzellen zu verwenden, trennen Forscher die Blastozysten oder primitiven Embryonen in einzelne Zellen und entfernen so die Fähigkeit des Embryos, sich zu entwickeln. Viele betrachten dies als präemptive Abtreibung sowie das Erschaffen von Menschen ausschließlich zu Forschungszwecken. Da die Definition des „Rechts auf Leben“ ein philosophischer und wissenschaftlicher Graubereich ist, entschied sich die NBAC, die Finanzierung für eine Forschungstechnik zu entfernen und/oder einzuschränken, die viele Menschen als anstößig empfanden.
Aufgrund der Aussetzung der Bundesfinanzierung für embryonale Stammzellforschung konzentrierten sich Wissenschaftler hauptsächlich auf Kerntransfertechniken. Durch die Übertragung des Kerns einer adulten Zelle in einen enukleierten Spendereizell konnten Wissenschaftler neue Stammzelllinien erstellen, die exakte genetische Übereinstimmungen für Patienten sind. Durch chemische Behandlung der neuen Stammzelllinien kann der Wissenschaftler gerichtete Zelltransformation fördern, beispielsweise nur Hautzellen oder Herzmuskel bilden. Ethisch eröffnet diese Forschungslinie Türen für menschliches Klonen sowie „Designer“-Kinder. Wissenschaftler könnten conceivably eine einzelne Zelle genetisch verändern und sie dann in einen Spenderembryo implantieren, um das „perfekte“ Kind zu erschaffen.
Bis Wissenschaft, Philosophie und/oder eine Regierungsbehörde den Zeitpunkt klar definiert, an dem Leben und das Recht auf Leben beginnen, wird die Debatte über die ethischen Bedenken der embryonalen Stammzellforschung und die aus der Stammzellforschung insgesamt gewonnenen Informationen auf unbestimmte Zeit anhalten.
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