Es gibt zwei Hauptverfahren, die üblicherweise zur Durchführung von Vaterschaftstests verwendet werden. Das erste beinhaltet eine Technologie, die Desoxyribonukleinsäure (DNA) amplifiziert, genannt Polymerase-Kettenreaktion (PCR). Das zweite beinhaltet die Analyse von Restfragmentlängenpolymorphismen; dies ist auch als Erstellen eines „DNA-Fingerabdrucks“ bekannt.
Zuerst wird DNA sowohl vom Kind als auch vom vermeintlichen Vater durch Abwischen des Mundes und Isolieren von Zellen aus den gesammelten Flüssigkeiten gewonnen.
Die DNA des Mannes und des Kindes wird durch Enzyme in Abschnitte geschnitten. Diese Abschnitte werden dann mithilfe des PCR-Verfahrens amplifiziert – oder vervielfacht.
Fluoreszierende Marker, die an spezifische Sequenzen der DNA binden, werden auf die Abschnitte aufgetragen. Wenn der Mann der Vater des Kindes ist, wird ihre DNA ähnliche Muster der Fluoreszenz enthalten.
Bei dieser Methode werden die DNA des Mannes und des Kindes mit speziellen Enzymen namens Restriktionsenzyme geschnitten. Die resultierenden Fragmente werden nach Größe mithilfe einer Technologie namens Gel-Elektrophorese verteilt.
Wenn die durch die DNA-Fragmente gebildeten Gel-Muster einen gewissen Grad an Ähnlichkeit zwischen den Fingerabdrücken des Mannes und des Kindes zeigen, wird der Mann als Vater des Kindes erklärt.

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