Das primäre pulmonale Abfallprodukt ist Kohlendioxid (CO₂) aus der Zellatmung. Beim Gasaustausch diffundiert CO₂ aus dem Blut in die Alveolen und wird ausgeatmet.
Die Lunge eliminiert auch Wasserdampf, Aceton (Ketose-Marker) und Spuren flüchtiger Verbindungen über die Ausatmung.

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