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DNA-Probenanforderungen für Gentests verstehen

Was sind DNA-Proben?

DNA-Proben sind Blutproben oder andere biologische Materialien, die von Einzelpersonen zur DNA-Analyse bereitgestellt werden. Sie werden häufig im medizinischen Bereich eingesetzt, um genetische Störungen wie vererbte Krankheiten zu diagnostizieren. Auch die Polizei nutzt sie, um strafrechtliche Fälle zu untersuchen, indem sie die Proben mit Beweismitteln vom Tatort, wie Blut oder Haare, abgleicht. In den USA regelt der Genetic Information Non-Discrimination Act die Erhebung, Analyse und Nutzung genetischer Informationen.

DNA-Massenanforderungen

  • Die insgesamt erforderliche DNA-Probenmasse setzt sich aus der Masse für Wiederholanalysen und der Masse für das Pipettieren zusammen. Beim Pipettieren wird eine definierte Menge DNA-Quellmaterial, beispielsweise Speichel, mit einem Laborgerät namens Pipette entnommen, um winzige Flüssigvolumina aufzunehmen. Daher hängt die geeignete DNA-Masse vom Umfang Ihres Projekts ab. Bei der Illumina Infinium HD-Genotypisierung sollten beispielsweise 200 Nanogramm (ng) pro Probe gesammelt werden. Bei der Illumina Golden Gate-Genotypisierung sind 250 ng pro Probe erforderlich.

DNA-Volumenanforderungen

  • Für die DNA-Analyse beträgt das für eine erfolgreiche Analyse erforderliche Mindestvolumen 5 Mikroliter (µl). Die Sammlung geeigneter Probenvolumina hängt jedoch von der Konzentration und der für die Analyse erforderlichen Probenmasse ab. Bei hochkonzentrierten Proben, bei denen das erforderliche Volumen unter 5 µl liegt, sollte die Probe verdünnt werden, bis das Volumen 5 µl beträgt. Wenn die DNA-Probe über eine lange Strecke transportiert wird, ist die beste Methode, sie als getrocknete Probe zu transportieren.

DNA-Konzentrationsbereich

  • DNA-Proben können als feuchte oder trockene Proben eingereicht werden. Die Konzentration von DNA-Proben hängt davon ab, ob sie feucht oder trocken sind. Bei feuchten DNA-Proben liegen die Mindestkonzentrationen für Uniplex- und Sequenom iPLEX-Assays bei 5 ng/µl, während sie für Illumina-Genotypisierung bei 50,0 ng/µl liegen. DNA-Proben sollten so konzentriert wie möglich sein. Wenn eine Verdünnung notwendig ist, sollte nur Wasser zum Verdünnen der Proben verwendet werden.

Probenkennzeichnung

  • Die gesammelte Probe sollte mit dem Namen und dem Geburtsdatum des Patienten gekennzeichnet werden. Ein Anforderungsformular sollte mit der Einwilligung des Patienten ausgefüllt und unterschrieben werden, und das Formular zusammen mit der DNA-Probe sollte an das Labor gesendet werden, in dem die Analyse durchgeführt wird.

Anforderungen an DNA-Proben und Platten

  • Bei der Einreichung von Proben sollten nur 96-Well-Platten verwendet werden. Diese Platten sollten vollständig versiegelt werden, um Kontaminationen während des Transports zu vermeiden. Die Masse, das Volumen und die Konzentration aller Proben sollten einheitlich und ausreichend sein, um eine erfolgreiche Analyse zu ermöglichen. In Fällen, in denen einer dieser Faktoren variiert, werden die DNA-Proben für die Analyse ausgeschlossen.

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