Schwefeldioxid ist zusammen mit Stickoxiden eine Quelle für sauren Regen. Zusätzlich zur Luftverschmutzung verursacht saurer Regen Boden- und Wasserverschmutzung und beschleunigt die Verschlechterung von Gebäuden und anderen Strukturen. Sobald es im Wasser ist, verursacht Schwefeldioxid die Versauerung von Flüssen, Seen und Bächen, was eine schädliche Wirkung auf Fisch- und Pflanzenleben im Wasser hat. Es wird auch angenommen, dass es zu einer Minerale depletion im Boden führt, was die Vegetation in Wäldern und anderen natürlichen Gebieten schädigt und die Ernteerträge in landwirtschaftlichen Gebieten reduziert.
Schwefeldioxid in der Atmosphäre reizt Augen, Nase und Rachen. Es schädigt auch die Lunge beim Einatmen, was langfristige, negative gesundheitliche Auswirkungen haben kann, insbesondere bei Personen mit Erkrankungen wie Asthma. Langfristige Exposition gegenüber Schwefeldioxid kann die Lungenkapazität verringern, insbesondere bei Kindern, und kann zu anderen Atemwegsproblemen führen. Auf sehr hohem Niveau kann Schwefeldioxid giftig sein, aber diese Niveaus werden selten als Folge von Luftverschmutzung aufgetreten, es sei denn, es befindet sich in einem geschlossenen Raum.
Seit die Gefahren des sauren Regens erstmals erkannt wurden, wurden Kontrollen und Filterprozesse eingerichtet, um Schwefeldioxid in der Atmosphäre zu reduzieren. Dies geschieht häufig mit „Wäschern“, die Schwefeldioxid mit Calciumoxid mischen, um Calcium sulfite zu produzieren und zu verhindern, dass es in die Atmosphäre gelangt. Seit 1980 wurde die Menge an Schwefeldioxid, die an 252 US-Teststellen gefunden wurde, um mehr als 80 Prozent reduziert. Stand 2006 war China, das stark auf Kohlekraftwerke angewiesen ist und wenige Umweltschutzkontrollen hat, der größte Emittent von Schwefeldioxid.
Schwefeldioxid wird häufig in Lebensmitteln und Getränken als Konservierungsmittel und Antioxidans verwendet, es ist besonders häufig in der Weinherstellung und in Erfrischungsgetränken. Ein Weinetikett mit den Worten „enthält Sulfite“ zeigt an, dass der Wein eine Konzentration von 10 ppm (parts per million) oder mehr hat. Obwohl es allgemein als sicherer Zusatzstoff angesehen wird, scheinen einige Personen eine größere Empfindlichkeit als andere zu haben. Schwefeldioxid wird manchmal auch als Reduktionsmittel verwendet, hat einige medizinische Verwendungen und wurde vor der Entwicklung von Freon einmal als Kältemittel verwendet.

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