Ölverschmutzungen haben verheerende Auswirkungen auf Meeresorganismen und Lebensräume. Jungfische, Amphibien und Weichtiere sind am empfindlichsten gegenüber Verschmutzung, da ihre Immunsysteme nicht vollständig entwickelt sind und sie bei schnellem Wachstum am stärksten von regelmäßiger Nahrungsaufnahme abhängig sind. Meeressäuger und Vögel haben nach einer Ölverschmutzung oft bessere Überlebenschancen, aufgrund ihrer begrenzten Fähigkeit, in andere Gebiete umzusiedeln.
Mehrere aus Öl abgeleitete Verbindungen haben nachweislich negative Auswirkungen auf Meeresorganismen. Viele dieser Verbindungen verursachen sofortigen Tod, insbesondere bei Larven und Jungtieren, oder verhindern die Nahrungsaufnahme. Sobald Öl die Wasseroberfläche bedeckt, blockiert es die Schnittstelle zwischen Atmosphäre und Wasser und verhindert den Gasaustausch, wie Sauerstoff und Stickstoff. Verschmutzung durch Ölverschmutzungen beeinträchtigt auch nachteilig Verhalten, Immunfunktion, Hormonsynthese und Fortpflanzungsfähigkeit, wodurch gesamte Populationen von Meeresorganismen gefährdet werden.
Fische, die auf der Oberfläche von Meeresgewässern entwickeln, sind besonders anfällig für Ölverschmutzungen. Eine Studie, die in der Februar-Ausgabe 2011 des "Marine Pollution Bulletin" veröffentlicht wurde, untersuchte die Auswirkungen von Ölverschmutzungen auf die Larven der japanischen Scholle. Die Autoren stellten fest, dass ein Protein, namens Sema3, das das Wachstum von Nervengewebe kontrolliert, in Schollenlarven, die Konzentrationen von mehr als 8,75 mg Öl pro Liter Meerwasser ausgesetzt waren, überexprimiert war. Die Forscher fanden heraus, dass das Nervengewebe in den ausgesetzten Fischen an abnormalen Stellen wuchs.
Polyzyklische aromatische Kohlenwasserstoffe sind Bestandteile von Erdöl und haben sich zuvor als induzierend für DNA-Schäden erwiesen. Eine Studie, die in der September-Ausgabe 2002 von "Marine and Environmental Research" erschien, untersuchte die Auswirkungen von PAHs auf Muscheln, darunter Miesmuscheln und Austern. Die Forscher fanden heraus, dass Erdölverschmutzungen kaum Auswirkungen auf Miesmuscheln hatten, stellten jedoch fest, dass DNA-Schäden in den Verdauungsdrüsen von Austern auftraten.
Mangroven schaffen entlang der Küsten Lebensräume, die wichtige Brutplätze und Nahrungsquellen für Meeresorganismen sind. Ein Artikel, der in der Februar-Ausgabe 1996 des "Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology" enthalten war, berichtete über die Auswirkungen von Ölverschmutzungen auf Mangrovenlebensräume. Die Autoren erklärten, dass nach einer Ölverschmutzung Überreste von Erdölverschmutzung in Mangroven verbleiben, aufgrund des reduzierten Sedimenttransports und des Fehlens aeroben Bakterien zur Abbau der Kohlenwasserstoffe. Die Studie konzentrierte sich auf Naphthalin, eine toxische Komponente, und seine Fähigkeit, das Verhalten von Gastropoden, der Klasse der Weichtiere einschließlich Schnecken, zu verändern.

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