Mikrobiologielabore unterstützen große medizinische Einrichtungen und Ärzte. Aktivitäten in diesen Laboren drehen sich um die Identifizierung von Bakterien, die Feststellung, gegen welche Medikamente ein bestimmtes Bakterium empfindlich ist, und die Ermöglichung von Maßnahmen des öffentlichen Gesundheits- und Sicherheitswesens. Die untersuchten Mikroben umfassen nicht nur Bakterien, sondern auch Viren, Pilze und Parasiten. Eine weitere Funktion von Mikrobiologielaboren ist die Durchführung von Forschungen an diesen Organismen.
Um die Diagnose von Infektionen zu erleichtern, untersuchen Mikrobiologielabore mehrere Körperflüssigkeiten auf Mikroben. Die Probenentnahme kann das Gewinnen von Proben aus Urin, Blut, Rachenabstrichen und anderen Quellen umfassen. Qualitativ hochwertige Proben, die nicht mit Mikroben aus der Atmosphäre kontaminiert sind, sind für eine genaue Diagnose notwendig.
Sobald eine Probe entnommen wurde, muss ein Mikrobiologielabor nach Mikroben oder mikrobiellen Produkten in der Probe suchen und diese charakterisieren. Techniken zur Entdeckung der Identität eines Mikroben umfassen Kultur auf einer Vielzahl selektiver Medien. Spezielle Färbungen und Mikroskopie werden ebenfalls verwendet. In einigen Fällen können Antigene oder Toxine, die von dem Mikroben produziert werden, nachgewiesen werden.
Um eine mikrobielle Infektion zu behandeln, ist es wichtig zu wissen, welche Antibiotika den infizierenden Mikroben abtöten können. Dies geschieht durch die Prüfung der Fähigkeit verschiedener Antibakterieller oder Antimykotika, das Wachstum des Mikroben in Kultur zu stoppen. Mikrobiologielabore helfen auch bei der Entwicklung und Prüfung neuer antimikrobieller Medikamente.
Mikrobiologielabore unterstützen verschiedene Programme des öffentlichen Gesundheitswesens und der Überwachung. Diese Aktivitäten umfassen Forschung an Mikroben, die häufig als Agenten des Terrors verwendet werden, wie Anthrax, oder an häufigen Infektionskrankheiten wie sexuell übertragbaren Krankheiten. Mikrobiologielabore können Wege erforschen, Mikroben für die alternative Energieerzeugung, Abfallrecycling und Lebensmittelgewinnung zu nutzen.

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