Die häufigste Nebenwirkung einer Bluttransfusion ist Fieber, das von Schütteln und Schüttelfrost begleitet sein kann. Eine fieberhafte Reaktion ist meist harmlos, führt aber oft zu einem Stopp der Transfusion, um schwerwiegendere Ursachen auszuschließen.
Diese schwere, aber seltene Reaktion tritt auf, wenn die Blutgruppen von Spender und Empfänger nicht übereinstimmen. Der Körper zerstört die neuen Blutzellen und produziert Substanzen, die die Nieren schädigen.
Der Körper greift die neu transfundierten Blutzellen einige Tage oder Wochen später langsam an. Meist treten keine Symptome außer einem sinkenden Blutbild auf. Diese Reaktion steht im Zusammenhang mit mehreren früheren Transfusionen.
Die Übertragung von Infektionen ist selten. Mögliche Infektionen umfassen HIV, Hepatitis B und C sowie die Creutzfeldt-Jakob-Krankheit. Cytomegalievirus, Syphilis, Malaria und das humane lymphotrope T-Zell-Virus 1 sind selten, aber möglich.

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