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Laut der University of Utah hat das Klonen eine extrem hohe Fehlerrate; nur 0,1 Prozent bis 3,0 Prozent der Versuche sind erfolgreich. Zwei Gründe für eine so hohe Fehlerrate sind die Inkompatibilität der Eizelle und des Kerns sowie die Tatsache, dass die Eizelle und der neu entwickelte Kern möglicherweise nicht richtig wachsen oder sich teilen. Wenn man speziell von tierischem Klonen spricht, könnte die Implantation des Embryos fehlschlagen oder die Schwangerschaft selbst fehlschlagen. Bei einer so niedrigen Erfolgsrate machen das Geld und die Zeit, die in diesen Prozess investiert werden, zusammen mit anderen Risikofaktoren, dies zu einem ziemlich teuren Experiment.
Großes-Nachwuchs-Syndrom (LOS) ist ein Zustand, bei dem Organe ungewöhnlich groß sind und zu Komplikationen wie Atembeschwerden und Durchblutungsproblemen führen kann. Diese Probleme sind gefährlich für die Gesundheit eines Tieres; verbunden mit der niedrigen Erfolgsrate neigen die überlebenden geklonten Tiere dazu, größer zu sein, und einige haben LOS. Die überlebenden Nachkommen, die kein LOS entwickeln, haben oft beeinträchtigte Immunsysteme oder Nieren- und Gehirnfehlbildungen.
Laut dem Human Genome Project neigen geklonte Tiere dazu, höhere Infektionsraten sowie beeinträchtigte Immunfunktion, Tumorwachstum und andere Störungen aufzuweisen. Die Lebensspanne ist derzeit nicht verifizierbar, weil ein geklonter Nachkomme noch nicht lange genug gelebt hat, um erforscht zu werden. Studien in Japan haben gezeigt, dass geklonte Mäuse extrem schlechte Gesundheit haben und infolgedessen früh sterben. Es ist schwierig zu bestimmen, wie lange ein geklonter Nachkomme leben wird, weil selbst wenn der Nachkomme in jungen Jahren gesund erscheint, dies offenbar kein guter Indikator für das langfristige Überleben ist.
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