Der antigenische Shift wird durch genetische Reassortment angetrieben – den Austausch von RNA-Segmenten zwischen verschiedenen Influenzastämmen, die einen Wirt gleichzeitig infizieren. Dies schafft neue Subtypen (z. B. H1N1, H5N1), gegen die die Bevölkerung kaum Immunität besitzt, was zu Epidemien oder Pandemien führen kann.
Unvorhersehbare Shifts stellen die Impfstoffentwicklung vor Herausforderungen und erfordern eine ständige globale Überwachung (GISRS) sowie jährliche Stammaktualisierungen.
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