Fluoreszenz wird als Detektionsmethode in vielen chemischen und biologischen molekularen Charakterisierungstechniken verwendet.
Fluoreszenz tritt auf, wenn Licht einer bestimmten Wellenlänge (oft Ultraviolett) auf ein Material gerichtet wird, das dieses Licht absorbieren und Licht bei einer anderen, längeren Wellenlänge emittieren kann. Oft ist diese Emission sichtbares Licht, wodurch das Material zu leuchten scheint.
Einige Moleküle sind von Natur aus fluoreszierend und können mittels direkter Fluoreszenz untersucht werden. Faktoren wie die Nähe zu anderen Molekülen und Lösungsmittelinteraktionen können die fluoreszierenden Eigenschaften eines Moleküls verändern. Diese Veränderungen liefern Informationen über molekulare Interaktionen, Aggregation und Selbstmontage.
Bei der Immunfluoreszenz werden fluoreszierende Antikörper verwendet, um bestimmte zelluläre Strukturen sichtbar zu machen. Dies kann verwendet werden, um Zellen verschiedener Typen zu identifizieren, bestimmte Zellorganellen zu visualisieren, den Zellstoffwechsel zu messen und für viele andere Zwecke.
Obwohl DNA selbst nur schwach fluoreszierend ist, basieren viele molekularbiologische Techniken auf der Herstellung fluoreszierender DNA-Komplexe zur Quantifizierung, Sequenzierung und Verfolgung.
Die Liste der fluoreszenden Detektionsmethoden ist lang und vielfältig. Proteine können so konstruiert werden, dass sie fluoreszierende Domänen enthalten, was es ermöglicht, sie innerhalb von Zellen und sogar innerhalb von Organismen zu verfolgen. Fluoreszenz kann in der Chromatographie verwendet werden, um ein interessantes Molekül aus einem Gemisch zu trennen, und in der Biophysik, um die Rate der Konformationsänderung eines einzelnen Moleküls zu bestimmen.

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