Die meisten Nebenwirkungen des H1N1-Impfstoffs sind mild, wie z. B. Schmerzen, Rötung oder Schwellung an der Injektionsstelle, leichtes Fieber, Kopf- und Muskelschmerzen, Müdigkeit und Übelkeit. Diese dauern in der Regel einige Tage. Schwerwiegendere Nebenwirkungen wie das Guillain-Barré-Syndrom sind sehr selten.
