ASD weist eine komplexe, heterogene genetische Architektur auf. Die wichtigsten Mutationskategorien umfassen:
Punktmutationen (Missense, Nonsense, Splice-Site), die die Kodiersequenz eines einzelnen Gens verändern. Können vererbt oder de novo sein.
Deletionen/Duplikationen großer DNA-Abschnitte (≥1 kb), die oft mehrere Gene umfassen. Stark mit ASD assoziiert (z. B. 16p11.2, 15q11-13).
Spontane Mutationen, die nicht in den Elterngenomen vorkommen. Bei ASD angereichert, insbesondere in Genen, die die neuronale Entwicklung, synaptische Funktion und Chromatin-Remodellierung regulieren.
Translokationen, Inversionen, Aneuploidien. Beispiel: Fragiles-X-Syndrom (FMR1 CGG-Expansion) – eine bekannte mit ASD assoziierte Erkrankung.
Genomweite Assoziationsstudien identifizieren zahlreiche gemeinsame SNPs mit kleinen individuellen Effekten, die gemeinsam zum polygenen Risiko beitragen.
Verschiedene Mutationen stören häufig gemeinsame Signalwege: synaptische Signalübertragung, transkriptionale Regulation, neuronale Erregbarkeit. Diese Konvergenz hilft, die phänotypische Variabilität zu erklären.

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