Tierärzte und Diagnoselabore müssen bestimmte tierische Krankheiten dem California Department of Food and Agriculture (CDFA) melden. Die sorgfältige Überwachung dieser Krankheiten wird verhindern, dass sie die Landwirtschaftsindustrie verwüsten. Die Meldung von Zoonosen, die auf Menschen übertragen werden können, verhindert auch Bedrohungen für die öffentliche Gesundheit. Die gefährlichsten Krankheiten müssen innerhalb von 24 Stunden gemeldet werden; einige davon sind hier aufgeführt. Die CDFA-Website (siehe Ressourcen) hat eine vollständige und aktuelle Liste der meldepflichtigen tierischen Krankheiten in Kalifornien.
Anthrax betrifft alle Warmblüter, obwohl Vögel scheinbar resistent dagegen sind. Die Krankheit ist am häufigsten bei Rindern, Schafen und Ziegen; der jüngste Ausbruch war 2007 im westlichen Teil der Vereinigten Staaten. Tiere bekommen Anthrax, indem sie Erde schlucken, die Anthraxsporen enthält. Es wird nicht von Tier zu Tier oder von Tier zu Mensch übertragen, aber wenn ein Fall von Anthrax entdeckt wird, wird das Gebiet unter Quarantäne gestellt und die Behörden stellen sicher, dass Kadaver ordnungsgemäß entsorgt werden.
Geflügelgrippe (H5N1) ist hoch ansteckend unter Vögeln und kann durch Kontakt mit infiziertem Geflügel auf Menschen übertragen werden. Ab 2010 war das Virus in Asien, Afrika, dem Pazifik und Europa gemeldet worden, aber nicht auf der Westhalbkugel. Menschen haben wenig Immunität gegen H5N1 – von den 450 seit 2003 gemeldeten Fällen waren 60 Prozent tödlich.
Diese Krankheit, verursacht durch das Brucella-Bakterium, betrifft Schweine, Rinder und Bisons. Die häufigste Art von Brucellose verursacht Aborte bei Rindern. Die Krankheit verbreitet sich durch direkten Kontakt mit infizierten Tieren. Menschen haben sich durch den Umgang mit kontaminiertem Gewebe oder das Trinken von roher, unpasteurisierter Milch mit Brucellose infiziert.
Die Johne-Krankheit infiziert den Magen-Darm-Trakt von Rindern und verursacht chronischen Durchfall und Gewichtsverlust. Es dauert mehrere Jahre, bis sie ausbricht, und ist schließlich tödlich. Kalifornien hat ein Programm eingerichtet, um die Krankheit aus den Herden im Staat durch Bildung, Management und Tests auszurotten. Tierärzte können ein Schulungsprogramm absolvieren, um Johne-Krankheit-zertifiziert zu werden.
Schabziege greift das zentrale Nervensystem von Schafen und Ziegen an und ist ähnlich der bovinen spongiformen Enzephalopathie (BSE). Es dauert mehrere Jahre, bis es auftritt, und ist für das Tier immer tödlich. Schabziege scheint Menschen nicht zu infizieren, aber ihre Anwesenheit in den USA verhindert den Export von Zuchtbestand aus diesem Land. BSE, oder „Rinderseuche“, ist ebenfalls in Kalifornien meldepflichtig.
Tollwut wird am häufigsten bei Wildtieren wie Waschbären, Skunks, Fledermäusen und Füchsen gefunden. Das Virus kann durch Kontakt mit dem Speichel eines infizierten Tieres auf andere Tiere und Menschen übertragen werden. Schraubenwürmer sind Fliegenlarven oder Maden, die jedes Warmbluttier infizieren können. Sobald sie unter der Haut sind, ernähren sie sich von lebendem Fleisch und können bei unbehandelter Verlaufsform zum Tod führen.

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