Verschmutzung ist eine sehr ernste Bedrohung für das Waldleben. Ob es nun saurer Regen oder die indirekte Auswirkung der globalen Erwärmung ist, viele Pflanzen- und Tierarten werden getötet oder gezwungen, sich schnell anzupassen. Infolgedessen kann das Waldökosystem aus dem Gleichgewicht geraten und schließlich zerstört werden. Das Verständnis der Auswirkungen von Waldverschmutzung ist der erste Schritt, um sie zu stoppen.
Obwohl Bäume und Pflanzen nicht empfindungsfähig sind, sind sie dennoch lebende Organismen. Wichtiger ist, dass sie das Rückgrat des Waldökosystems sind, da ein Wald ohne Vegetation nicht existieren kann. Die größte Bedrohung für diese Organismen ist saurer Regen, der Chemikalien wie Schwefelsäure und Salpetersäure enthält. Saurer Regen beeinträchtigt Bäume, indem er das Wachs auf den Blättern zerstört und sie anfälliger für Insekten macht. Nährstoffe gehen ebenfalls verloren, was letztendlich den Baum tötet. Darüber hinaus erreicht saurer Regen die Wurzeln des Baumes, vergiftet sie und hemmt das Wachstum des Organismus.
Obwohl sie oft unbemerkt bleiben, sind kleine Organismen im Wald genauso wichtig für die Aufrechterhaltung des Ökosystems. Wenn diese kleinen Kreaturen im Boden saurem Regen ausgesetzt werden, wird das Atmen schwieriger. Infolgedessen sind sie weniger effizient beim Verzehr und Zersetzen von Blättern und anderen biologischen Materialien. Im Gegenzug zersetzen sich diese Materialien nicht so schnell. Das Endergebnis ist, dass Nährstoffe, die normalerweise aus dieser Zersetzung freigesetzt werden, nicht in den Boden verteilt werden, um die Bäume zu ernähren.
Ein weiterer Effekt von Waldverschmutzung ist das Ungleichgewicht, das durch den Tod von Raubtieren verursacht wird. Zum Beispiel, wenn Insektenfresser getötet werden, ermöglicht dies ihren Beutetieren, sich in größerer Zahl fortzupflanzen. Insekten, die sonst eine bestimmte Nische in diesem Ökosystem besetzten, beginnen an Zahl zuzunehmen und werden zu Schädlingen. Ironischerweise sind es Pestizide, die diese Situation schaffen, indem sie die Raubtiere töten und neue Schädlinge hervorbringen.
Saurer Regen ist nicht die einzige Verschmutzung, die Waldökosysteme beeinträchtigt. Die globale Erwärmung hat ebenfalls Probleme geschaffen. Die Biodiversität – die Vielfalt des Pflanzen- und Tierlebens – kann ebenfalls beeinträchtigt werden. Laut der First National Assessment of the Potential Consequences of Climate Variability and Change könnten Gebiete einschließlich der Appalachen und der Region der Großen Seen eine Vielzahl von Baumarten verlieren. Erhöhte globale Temperaturen könnten auch Tiere aus ihren Lebensräumen vertreiben oder diese Tiere durch Arten ersetzen, die bei wärmerem Wetter überleben können.

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