Laut den National Institutes of Health kann während einer virtuellen Koloskopie verwendete Strahlung Schäden an menschlichen Zellen verursachen. Große Strahlendosen können die Wirksamkeit des Immunsystems verringern und Grauer Star verursachen.
Das Center for Radiological Research schätzt, dass das Krebsrisiko, das mit der Strahlenbelastung bei einer virtuellen Koloskopie verbunden ist, bei einem 50-Jährigen etwa 0,14 Prozent beträgt.
Die Zellen einer Person teilen sich mit zunehmendem Alter langsamer; dies führt zu einem geringeren Krebsrisiko durch Strahlung. Ein 70-Jähriger hat ein Risiko von etwa 0,07 Prozent durch eine virtuelle Koloskopie.
Der Dickdarm, die Blase und der Magen sind die am häufigsten von strahleninduziertem Krebs bei virtueller Koloskopie betroffenen Organe.
Eine virtuelle Koloskopie während der Schwangerschaft wird nicht empfohlen, da CT-Scan-Strahlung fetale Schäden verursachen kann, insbesondere am Gehirn.

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