CNS-Karten in CCP4 konvertieren: Eine Schritt-für-Schritt-Anleitung

CNS ist eine Gruppe von Programmen, die von einer Gruppe von Universitäten erstellt wurden. Es analysiert und erstellt Karten für Kristallographie und NMR im medizinischen Bereich. Ein weiteres Programm, das diese gleiche Funktion ausführt, ist CCP4. Allerdings speichern diese beiden Programme ihre Dateien mit zwei verschiedenen Erweiterungen. Die Konvertierung von CNS-Karten in CCP4-Karten erfordert das Verständnis, wie man das MAPMAN-Programm von USF verwendet. Sie müssen in der Lage sein, die Befehlszeile in diesem Programm zu verwenden, um die spezifischen, notwendigen Befehle einzutippen.

Anleitung

1. Öffnen Sie MAPMAN und wählen Sie die Option „Befehlszeile“ aus dem oberen Menü. Dies öffnet eine tipbasierte Befehlszeilenprogrammierungsmethode.

2. Tippen Sie „read m1 ${prefix}_1fofc.map CNS“ in die erste Befehlszeile ein. Ersetzen Sie die „${prefix}“-Zeile mit dem Basispfad und dem Dateinamen Ihrer CNS-Karte. Drücken Sie die „Enter“-Taste, um zur nächsten Zeile zu gelangen.

3. Geben Sie die Zeile „read m2 ${prefix}_2fofc.map CNS“ ein und geben Sie den Basispfad und den Dateinamen der zweiten Karte ein, die Sie konvertieren möchten. Drücken Sie „Enter“, um zur nächsten Zeile zu gelangen. Fügen Sie so viele Karten hinzu, wie Sie konvertieren möchten.

4. Tippen Sie „write m1 ${prefix}_1fofc.map CCP4“ in die nächste Zeile, indem Sie „${prefix}“ durch den Basispfad und den Dateinamen ersetzen, unter dem Sie Ihre konvertierte Karte speichern möchten. Drücken Sie „Enter“ und fügen Sie auf die gleiche Weise eine neue Zeile für jede Karte hinzu, die Sie konvertieren.

5. Geben Sie „quit“ als letzte Zeile ein und drücken Sie „Enter“, warten Sie, bis Ihr Programm ausgeführt wurde, und überprüfen Sie dann den Basispfad, unter dem Sie Ihre konvertierten Karten gespeichert haben. Stellen Sie sicher, dass Ihre konvertierten Karten hier gespeichert wurden. Öffnen Sie diese neuen Karten mit CCP4.