Eine Choana verbindet die Nasenhöhle mit dem Rachen. Da der hintere Teil der menschlichen Nasenhöhle durch einen Knochen namens Vomer in zwei Teile geteilt ist, haben Menschen zwei Choanen, eine für jede Seite der Nase. Die Choana kommt auch bei anderen luftatmenden Wirbeltieren vor. Bei Vögeln erscheint die Choana als eine Rinne oder ein Schlitz im Gaumendach. Tierärzte tupfen die Choana von Vögeln ab und verwenden die daraus resultierende Choanalprobe als Diagnosewerkzeug für verschiedene Vogelkrankheiten.
Wie Rickettsien und Chlamydien ist Mykoplasma erheblich kleiner als andere Bakterien. Aufgrund ihrer geringen Größe entgehen sie einer oberflächlichen mikroskopischen Untersuchung, und da sie keine Zellwand haben, offenbart eine Gram-Färbung nicht ihr Vorhandensein. Die Spezies Mycoplasma synoviae infiziert Geflügel wie Truthähne und Hühner. Es verursacht lunenähnliche Symptome und infiziert auch Gelenke und Sehnen. Um die Krankheit zu diagnostizieren, tupft der Tierarzt die Choalenspalte des Vogels ab und unterzieht die daraus resultierende Probe anspruchsvollen Tests, die auf Antikörpererkennung basieren.
Chlamydia psittaci ist eine Vogel-Atemwegserkrankung, die oft zum Tod führt. Hauspapageien erkranken oft an dieser Krankheit. Sie kann sich auch auf Menschen und Tiere wie Katzen ausbreiten. Im Falle möglicher Vogelinfektionen verwenden Tierärzte Choanalproben, um auf Antikörper zu prüfen, die der Vogel als Reaktion auf diese Krankheit produziert. Die Anwendung von Fluorescein-Färbungen ermöglicht die Beobachtung der Antikörper. Die Diagnose ist jedoch schwierig, und die Befunde der Choanalprobe müssen durch andere Tests ergänzt werden. Beim Menschen werden klinische Proben normalerweise nicht von den Choanen entnommen, sondern aus leicht zugänglichen Quellen wie Auswurf oder Speichel.
Die Bakteriengattung Bordetella verursacht Atemwegsinfektionen. Beispielsweise ist Bordetella pertussis der Erreger von Keuchhusten beim Menschen. Bordetella avium infiziert die Atemwege von Truthähnen und verursacht eine Krankheit namens Truthahn-Schnupfen. Choanalproben dienen als Diagnosewerkzeug.
Es ist nicht möglich, ein Virus mit einem Lichtmikroskop zu sehen. Aus diesem Grund wird das Vorhandensein eines Virus üblicherweise durch die Untersuchung der als Abwehrmechanismus produzierten Antikörper geschlossen. Choanalproben helfen, bestimmte Vogelviren zu erkennen, wie Atadenovirus und Psittacid-Herpesvirus. Atadenoviren infizieren Hühner, Gänse und Enten. Sie verursachen einen Rückgang der Eierproduktion und die Produktion von abnormalen Eiern. Psittacid-Herpesvirus verursacht eine Atemwegsinfektion bei Vögeln wie Papageien und Sittichen.

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