Die genaue Prävalenz der kortikalen Dysplasie ist unbekannt, da sie oft schwer zu diagnostizieren ist und wie andere Erkrankungen fehldiagnostiziert werden kann. Studien gehen jedoch davon aus, dass etwa 1–2 % der Bevölkerung von kortikaler Dysplasie betroffen sind. Einige Schätzungen gehen sogar von bis zu 4 % aus.
