Magensaft enthält Pepsin, ein Proteasen-Enzym, das die Proteinverdauung im Magen einleitet. Pepsin wird von den Hauptzellen als inaktives Pepsinogen abgesondert und durch Salzsäure (HCl) aktiviert.
Pepsin wirkt zusammen mit HCl (das Proteine denaturiert und Spaltstellen freilegt) und Magenspaltung (geringe Fettverdauung). Der resultierende Chymus gelangt in den Dünndarm, wo pankreatische Proteasen (Trypsin, Chymotrypsin) und Borstenrand-Enzyme die Proteinverdauung zu resorbierbaren Aminosäuren abschließen.

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