Die dramatischen Auswirkungen der Überfischung auf die weltweiten wilden Fischbestände haben einige Aufmerksamkeit erhalten. Allerdings reduziert auch anthropogene, oder vom Menschen gemachte, Verschmutzung viele wilde Fischarten sowohl in Süßwasser- als auch in Meereslebensräumen. Der Schaden umfasst, geht aber über massive Fischsterben hinaus, die durch plötzliche große Freisetzungen von rohem Abwasser oder giftigen Chemikalien in die Wasserversorgung resultieren. Einige Schadstoffe beeinträchtigen die Fähigkeit verschiedener Fische, ihre eigene Art fortzupflanzen.
Alle Fische entstehen aus der Kombination von männlichem Sperma und weiblichen Eizellen. Sie variieren ansonsten stark in ihren Fortpflanzungsstrategien. Bei einigen Arten setzt die Weibchen Eizellen aus ihrem Körper frei und das Männchen befruchtet sie. Bei anderen setzt er sein Sperma in ihren Körper frei. Bei lebendgebärenden Arten trägt die Mutter die Jungen in sich. Einige wenige Arten von Fischen haben natürliche Zwitter, Individuen mit sowohl eierproduzierenden als auch spermienproduzierenden Geweben. Wie auch immer es geschieht, die Fortpflanzung von Fischen hängt von komplizierten, empfindlichen Zyklen und Abfolgen von Hormonen ab.
Zahlreiche Wasserschadstoffe schaden dem aquatischen Leben, einschließlich Fischen. Obwohl sie seit langem aus der Industrie verboten sind, persistieren polychlorierte Biphenyle, oder PCB's, in der Umwelt. Schwermetalle wie Blei, Arsen und Quecksilber stammen hauptsächlich aus dem Bergbau und anderen industriellen Prozessen. Andere industrielle Toxine umfassen Bisphenol A und Phthalate. Polykalische aromatische Kohlenwasserstoffe, oder PAH's, wie Naphthalen, resultieren aus Erdölverschüttungen und der Verbrennung fossiler Brennstoffe. Pestizide wie DDT – das noch in einigen Teilen der Welt verwendet wird – und Heptachlor gelangen durch landwirtschaftlichen und sogar städtischen Oberflächenabfluss ins Wasser.
PCB's, Schwermetalle, PAH's und Pestizide sind bekannte endokrine Disruptoren, oder EDC's, die natürliche Geschlechtshormone wie Östrogene nachahmen. Mit ihren sehr durchlässigen Hauten und Kiemen konzentrieren Fische EDC's stark in ihren Körpern, besonders in den Hoden und Eierstöcken, ihren männlichen und weiblichen Geschlechtsorganen. Fischembryonen oder -larven können an solchen Schadstoffen sterben, da sie keine schützenden Schalen haben. Erwachsene Fische können unfruchtbar gemacht werden. Zahlreiche Männchen von Arten ohne natürliche Zwitter sind „verweiblicht“ geworden. Ihre Hoden können abnormal klein oder langsam wachsend sein oder ovariales Gewebe enthalten. EDC's behindern auch die Entwicklung des Fortpflanzungstrakts bei Weibchen.
Die verheerenden Folgen von EDC's für Fische und ihre Fortpflanzungssysteme haben viele ökologische und ethische Implikationen. Fische sind für aquatische Nahrungsketten unerlässlich, die mit terrestrischen oder Landnahrungsketten verbunden sind, einschließlich solcher, die Menschen ernähren. Die wissenschaftliche Literatur zeigt zunehmend, dass Fische nicht unempfindlich sind, sondern wahrscheinlich Emotionen wie Schmerz und Angst empfinden können. Daher gibt eine wachsende, wenn auch umstrittene Überzeugung, dass Menschen eine ethische Verantwortung haben, Fische nicht zu schädigen.

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