Landwirtschaftliche, industrielle und häusliche Aktivitäten sind die Hauptursachen für Süßwasserverschmutzung. Pestizide und andere chemische Substanzen, selbst wenn sie nicht direkt in Flüsse und Seen gekippt werden, werden über Regen in die Atmosphäre freigesetzt und vergiften Meeresleben. Menschlicher und tierischer Abfall verschmutzt auch Wasservorräte, die auch als Trinkwasser in Entwicklungsländern genutzt werden, die sich keine Wasseraufbereitungsanlagen leisten können. Während Süßwasserquellen nachhaltig sind, bedeutet Verschmutzung, dass nicht genug sicheres Trinkwasser für alle vorhanden ist.
Organische Substanz, insbesondere menschlicher Kot, ist laut der Website Good Planet die Hauptursache für Süßwasserverschmutzung. Solche Verschmutzung verhindert, dass Ökosysteme normal funktionieren, weil sie Wasserwildtiere tötet. Zusätzlich verunreinigen die krankheitserregenden Mikroorganismen in menschlichem und tierischem Abfall Flüsse und Seen, wenn das Wasser nicht behandelt wird.
Pestizide, Nitrate aus Düngemitteln und andere Chemikalien verunreinigen Gewässer und unterirdische Wasserquellen, weil sie in die Atmosphäre freigesetzt und mit dem Regen wieder herunterfallen. Säure- und Nuklearverschmutzung verunreinigt das Süßwasserökosystem indirekt auf diese Weise.
Krankheiten im Zusammenhang mit Süßwasserverschmutzung töten jedes Jahr 2,2 Millionen Menschen, wobei die größte Auswirkung auf Entwicklungsländer fällt, die sich keine Wasseraufbereitungssysteme leisten können und gezwungen sind, verschmutztes Wasser zu trinken, laut Good Planet. Zu viele Nitrate im Wasser sind für Menschen giftig, während die in menschlichem und tierischem Kot enthaltenen Mikroorganismen Krankheiten übertragen. Malaria und Dengue-Fieber treten auf, wenn Mücken verschmutztes Wasser aufnehmen und die Krankheit auf Menschen übertragen.
Süßwasserverschmutzung schädigt das Wasserökosystem. Sie tötet einheimisches Meeresleben und verursacht Tumore und Missbildungen. Robustere Arten von Meeresleben mögen gedeihen, während andere abnehmen, wodurch das Gleichgewicht des Ökosystems gestört wird. Luftgetragene Schadstoffe sind giftig für Fische und folglich für die Menschen und Tiere, die von ihnen als Nahrungsquelle abhängen.
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