Notaufnahme-Protokolle basieren im Allgemeinen auf den Zuständen der Patienten, wenn sie in der Notaufnahme erscheinen. Im Falle von Massenverletzungen, wie einem Busunfall, einer Explosion, einem mehrfachem Auffahrunfall oder einem anderen schweren Ereignis, wird eine Notaufnahme, die Patienten annimmt, normalerweise eine Triage einrichten, um Patienten bei ihrer Ankunft zu beurteilen und die am schwersten Verletzten an die Spitze der Schlange zu schicken. Unter gewöhnlicheren Umständen haben Krankenhaus-Notaufnahmen Protokolle für eine Vielzahl von medizinischen Zuständen; jedes Krankenhaus legt seine eigenen Notfallprotokolle fest. Zu den schwerwiegendsten Zuständen gehören Schlaganfälle, koronare Herzkrankheiten und traumatische Verletzungen wie innere Verletzungen, Schusswunden, Knochenbrüche, starke Blutungen und Kopfverletzungen.
Die Notfallmedizinische Abteilung der Universität von Cincinnati hat Protokollrichtlinien entwickelt, um Notaufnahme-Personal bei der Beurteilung eingehender Patienten zu unterstützen. Ausgehend von der Prämisse, dass eine Notaufnahme den täglichen Patientenstrom nicht vorhersagen kann, kann sie die Qualität der Patientenversorgung vorhersagen, die von Notfallärzten geleistet wird. Die Universitätsärzte haben Richtlinien für 20 häufig auftretende Zustände festgelegt. Solche medizinischen Probleme wie Schlaganfälle, Diabetes, Asthma, Lungenentzündung, Herzinfarkte und andere Umstände werden abgedeckt. Ebenso hat Maine Health in Portland eine Reihe von Notfallprotokoll-Websites für Notaufnahme-Personal erstellt, um eine konsistente Diagnose und Behandlung häufig auftretender Zustände sicherzustellen.
Im Missouri Baptist Medical Center in St. Louis ist ein Arzt 16 Stunden am Tag im Triage-Team. Jetzt arbeitet ein Arzt und eine Triage-Krankenschwester Seite an Seite bei der Beurteilung von Patienten. Dieses Protokoll hat zu einer Verringerung der Wartezeit geführt, und oft ist der Triage-Arzt der einzige Arzt, den der Patient sehen muss. Zusätzlich hat die Notaufnahme für jeden Patienten eine elektronische Patientenakte, in der alle Ärzte wichtige Informationen zusammen mit der vorgeschriebenen Behandlung oder benötigten Tests oder Medikamenten sowie Warnungen für das Pflegepersonal eingeben können. Diese Protokolle haben zu einer verbesserten Patientenversorgung geführt.
Das White Plains Hospital in New York hat eine Reihe neuer Protokolle etabliert, die einen Wiederbelebungsbereich für kritische Herzkranke, sowie Notfall-Ballonbehandlung und Unterkühlungstherapie für Herzinfarktpatienten umfassen; schnelle Reaktion für Personen, die Symptome eines Schlaganfalls zeigen; eine erhöhte Anzahl von Betten für Notfallpatienten; Röntgengeräte in der Notaufnahme und Unterdruckräume für Patienten mit Infektionskrankheiten. Das Parkland Memorial Hospital in Dallas hat eine Rapid Disposition Unit eingerichtet, die nun Krankenschwestern und Notfallsanitäter hat, die Notaufnahmepatienten konsultieren, sobald sie dort ankommen, indem sie das Notaufnahmepersonal besser über wartende Patienten informiert. Das Krankenhaus hat 20 Krankenschwestern und Notfallsanitäter hinzugefügt, um die Veränderung zu bewältigen, was sofort einen Unterschied machte. Zur Effizienz der Notaufnahme trägt eine umgenutzte Klinik bei, die nun nicht-notfallmäßige Patienten behandelt.

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