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Mücken und Obstfliegen werden häufig verwechselt; sie sind beide winzige, fliegende Insekten und es ist schwer, zwischen den beiden zu unterscheiden. Sie sind verwandt, beide gehören zur gleichen Ordnung, Diptera. Es gibt mehrere verschiedene Arten von Mücken und drei Arten von Obstfliegen. Der offensichtlichste Unterschied zwischen den beiden ist, dass Mücken im Allgemeinen Blut (entweder tierisch oder menschlich) saugen, während Obstfliegen sich von Früchten und Gemüse ernähren. Einige Mücken ernähren sich zwar von Pflanzenmaterial, sind aber nicht häufig in Häusern zu finden.
Die meisten Mücken sind sehr klein und die Bisse, die sie zufügen, sind harmlos. Zwei Arten von Mücken ernähren sich von Pflanzen oder verrottetem Gemüsematerial und legen Eier darin ab, anstatt Blut zu saugen; dies sind die Gallmücke und die Pilzmücke. Die Gallmücke legt ihre Eier auf Pflanzen und die Larven ernähren sich dann von der Pflanze, was der Pflanze großen Schaden zufügen kann. Die Pilzmücke ist weniger zerstörerisch, da sie ihre Nahrung auf Pilze und verrottende Pflanzen beschränkt.
Die Büffelmücke ist viel größer und ist gemeinhin als Schwarze Fliege bekannt. Schwarze Fliegen beißen sowohl Menschen als auch Tiere. Diese Bisse können quälend sein, und Schwärme sind dafür bekannt, Nutztiere zu Tode zu beizen. Die Büffelmücke ist jedoch aufgrund ihrer Größe leicht von anderen Mücken und von Obstfliegen zu unterscheiden. Die meisten Insektenschutzmittel wirken, um Schwarze Fliegen vom Beißen abzuhalten.
Die drei Arten von Obstfliegen umfassen die gemeine Obstfliege, die mexikanische Obstfliege und die mediterrane Obstfliege. Alle drei ernähren sich ausschließlich von Früchten und Gemüse. Die mexikanische Obstfliege und die mediterrane Obstfliege werden als schädliche Schädlinge angesehen, weil sie ihre Eier in unreife Früchte legen und die Larven diese Ernten dann beschädigen. Die gemeine Obstfliege ist eher eine Plage, da sie sich normalerweise nur von reifen oder verrotteten Früchten ernährt.
Die gemeine Obstfliege ist auch aufgrund ihrer Verwendung in der Genetikforschung von Interesse. Obstfliegen werden von Wissenschaftlern bevorzugt, weil sie schnell und leicht sich vermehren. Sie altern auch relativ schnell. Obstfliegen sind in warmem Wetter und warmen Klimazonen sehr häufig und sind leicht zu vermeiden, indem man frische Früchte und Gemüse abgedeckt oder gekühlt aufbewahrt.
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