Chromosom 6 beim Menschen enthält Gene, die für ein gesundes Immunsystem unerlässlich sind. Die Prüfung der humanen Leukozytenantigene (HLA) findet manchmal unannehmbare HLA-Werte. Die engste Korrelation mit bestimmten Krankheiten betrifft HLA-B27. Ankylosierende Spondylitis, Reiters Syndrom und Sakroiliitis sind drei Krankheiten, die eindeutig mit unannehmbar hohen HLA-Werten in Verbindung stehen. Auch laut der U.S. National Library of Medicine sind bestimmte HLA-Werte ein Grund zur medizinischen Besorgnis bei Organtransplantationen.
Im Januar 2004 veröffentlichte die „Journal of the Royal Society of Medicine“ einen Artikel über den starken Zusammenhang zwischen HLA und arthritischen Erkrankungen, insbesondere Reiters Syndrom, auch als reaktive Arthritis bekannt, und ankylosierende Spondylitis. Dies sind chronische Krankheiten mit einem genetischen Zusammenhang, der durch HLA gekennzeichnet ist. Reiters Syndrom verursacht eine Entzündung der Augen und der Harnwege. Ankylosierende Spondylitis ist eine Erkrankung der Wirbelsäule. Frühsymptome umfassen Schmerzen und Steifheit im unteren Rücken. Schließlich, wenn die Entzündung anhält, versucht der Körper zu heilen, indem er verschmilzt, und die Wirbelkörper wachsen langsam zusammen.
Sakroiliitis ist eine Entzündung eines oder beider Iliosakralgelenke. Diese Krankheit verursacht Schmerzen im unteren Rücken, Gesäß und Beinen. Unfälle oder Verletzungen können Sakroiliitis verursachen. Die Mayo Clinic identifiziert, dass genetische inflammatorische Arthritis, sogenannte Spondyloarthropathien, ebenfalls eine Ursache ist. Ärzte führen Humane Leukozytenantigen-Tests (HLA) durch, um auf diesen Zusammenhang zu prüfen. Hohe Werte können auf eine genetische statt umweltbedingte Ursache der Sakroiliitis hindeuten. Behandlungen umfassen Schmerzmittel, Muskelrelaxantien und Physiotherapie zur Erhöhung der Beweglichkeit. Bei schweren Schmerzen verwenden Ärzte Radiofrequenzenergie, um Nervengewebe zu zerstören.
Allografts sind Gewebe oder Organe, die von einem Individuum auf ein anderes transplantiert werden. Ein großes Problem ist, dass der Wirt das transplantierte Gewebe als fremd betrachten kann und das Immunsystem angreift. Wenn Organe von einem uneiigen Zwilling zum anderen transplantiert werden, tritt dies nicht auf. Das United Network for Organ Sharing (UNOS) testet auf Histokompatibilität, indem es Daten zu Antigenen sammelt, speziell Transmembranproteine und Polypeptide. UNOS versucht, die folgenden Bereiche abzugleichen: HLA-A, HLA-B und HLA-DR. Wenn diese Werte nicht akzeptabel ist, geht die Organsuche weiter.

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