Laut der Weltgesundheitsorganisation (WHO) liefert die bakteriologische Untersuchung von Wasser den aussagekräftigsten Test für gefährliche Fäkalverunreinigungen. Eine Trinkwasserquelle sollte häufig getestet werden; komplexe Tests auf spezifische Krankheitserreger können jedoch zeitaufwendig und kostspielig sein. Einfache Tests auf Darmerkrankungen, die Typhus und Ruhr verursachen, können die Art der Verschmutzung sowie die entsprechende Behandlung anzeigen.
Aufgrund der Vielfalt menschlicher Fäkalkeime – Protozoen, Viren, Bakterien – ist die Nachweisung einzelner Erreger im Wasser nicht durchführbar. Ein Organismus, der normalerweise im Verdauungstrakt warmblütiger Tiere vorkommt, Escherichia coli (E. Coli), kommt hingegen nicht in Süßwasser vor. Wird er im Wasser entdeckt, kann laut der Western Washington University von einer Fäkalverunreinigung ausgegangen werden. Verschiedene Tests können feststellen, ob die Wasserversorgung Kolibakterien enthält, eine Gruppe, zu der E. Coli gehört.
Der Test auf die Gesamtkeimzahl (auch Standardplattenzahl oder Koloniezahl genannt) ergibt die Gesamtzahl der Mikroorganismen in einer Wasserprobe. Das zu untersuchende Wasser wird zuerst mit verflüssigter Hefeextrakt-Agar vermischt und dann in Petrischalen zum Erstarren gegossen. Während ein Satz von Platten drei Tage lang bei 20 bis 22 °C inkubiert wird, wird ein anderer Satz einen ganzen Tag lang bei 37 °C inkubiert. Bakterien, die im Wasser gedeihen, tun dies leichter bei der niedrigeren Temperatur. Beide Sätze werden dann getrennt gezählt. Der Test auf die Gesamtkeimzahl wird am häufigsten verwendet, um die Hygiene eines Wasserverteilungssystems oder die Eignung einer großen Wasserversorgung für die Zubereitung von Lebensmitteln und Getränken zu beurteilen, berichtet Microbiologyprocedure.com.
Verschiedene Mengen der Wasserprobe werden in Röhrchen mit einem Nährmedium gegossen. Ist das Wasser verunreinigt, vermehren sich die Bakterien und erzeugen Säure mit oder ohne Gas. Laut der Weltgesundheitsorganisation kann die wahrscheinlichste Zahl (MPN) von Bakterien in der ursprünglichen Wasserprobe statistisch aus der Anzahl der beimpften Röhrchen und der Anzahl mit positivem Ergebnis abgeleitet werden. Das Mehrröhrchenverfahren kann für viele Arten von Wasser eingesetzt werden, von Abwasser bis hin zu Bodenpartikeln.
Wenn die Anzahl der Schadstoffbakterien in der Wasserprobe gering ist, bieten Membranfilter-(MF-)Techniken einen effektiven Weg, um bestimmte Bakterienkolonien zu isolieren. Bei diesem Verfahren passiert eine 100-mL-Wasserprobe eine 47-mm-Membran, die nicht nur einen Trichter, sondern auch ein Vakuumsystem umfasst. Bakterien, die auf der Membranoberfläche zurückgehalten werden, werden dann in einer Petrischale mit einem geeigneten Medium platziert. Nach der Inkubation produzieren die Bakterien Kolonien, die dann gemessen werden können, berichtet die Pall Corporation.
Mehrere Arten von Krankheitsausbrüchen können durch Wasser mit Fäkalbakterien verursacht werden. In der jüngeren Geschichte traten am häufigsten Typhus (Salmonella typhi) und Bazillenruhr (Shigella) auf. Zusätzlich wurden Cholera und andere Arten von Ruhr (Campylobacter und Escherichia coli) sowie Viren wie Hepatitis und Polio in verunreinigtem Wasser entdeckt, berichtet das Public Health Museum in Massachusetts.

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