Die Nutzung eines Whirlpools gilt allgemein als sicher, wenn der Spa gemäß den Richtlinien des Herstellers gereinigt und gewartet wird. Wenn das Wasser jedoch nicht regelmäßig gewechselt wird und Chlor- und pH-Werte nicht sorgfältig überwacht werden, kann ein Whirlpool zu einem Brutgebiet für Infektionskrankheiten werden. Durch die Düsen des Whirlpools erzeugte platzende Blasen tragen dazu bei, Keime mittels eines feinen Aerosolnebels in die Lunge zu gelangen.
Die am häufigsten mit der Whirlpool-Nutzung in Verbindung gebundene Erkrankung ist Dermatitis, eine reizende Hautinfektion, die durch das Bakterium Pseudomonas aeruginosa verursacht wird. Dieses Bakterium kann auch Ohr-, Augen- und Harnwegsinfektionen verursachen.
Das Herpes-simplex-Virus kann mehrere Stunden auf Kunststoffsitzen von Whirlpools überleben, die nicht ständig mit chloriertem Wasser in Kontakt stehen. Genitalherpes kann als Folge der Whirlpool-Nutzung übertragen werden.
Mit Symptomen, die an Grippe erinnern – Fieber, Schüttelfrost, Husten, Muskelschmerzen, Kopfschmerzen und Atemnot – kann eine Infektion mit dem Bakterium Legionellosis die Legionärskrankheit verursachen, die wiederum zu einer Lungenentzündung führt. In ihrer weniger schwerwiegenden Form, genannt Pontiac-Fieber, hat die Infektion größtenteils dieselben Symptome, führt jedoch nicht zu einer Lungenentzündung.
Diese bakterielle Infektion kann schwere Lungen- und Atemnot verursachen, insbesondere bei kleinen Kindern, älteren Menschen und Personen mit geschwächtem Immunsystem.
Kryptosporidium ist ein Parasit, der in menschlichem und tierischem Kot vorkommen kann. Wenn mit diesem Parasiten infiziert, können schwerer Durchfall, Übelkeit, Erbrechen und Dehydration die Folge sein.

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